由于涉及Treg细胞耗损的治疗策略受到并发自身免疫性疾病的限制，因此需要确定肿瘤内Treg细胞特异性调节机制以进行选择性靶向。在这方面，一些分子或途径已被证明对肿瘤内Treg细胞具有特异性。然而，目前尚不清楚是否存在对肿瘤内Treg细胞重要而对外周Treg细胞不重要的表观遗传调控机制。

近日，中国科学院遗传与发育生物学研究所肖军课题组在Molecular Plant在线发表了题为“Systemic identification of wheat spike development regulators by integrated multiomics, transcriptional network, GWAS and genetic analyses”的研究论文，通过结合多维组学、群体遗传学和基因功能解析等多种研究手段，提出了一种系统高效鉴定关键调控因子的策略。

近日，上海科技大学生命科学与技术学院戚炜课题组在学术期刊Advanced Science上在线发表题为“BMP-ACVR1 Axis is Critical for Efficacy of PRC2 Inhibitors in B-Cell Lymphoma” 的研究论文，阐明了PRC2抑制药物通过激活BMP-ACVR1通路抑制B细胞淋巴瘤生长的新机理。戚炜课题组长期研究表观遗传蛋白机器PRC2在肿瘤及其他重大疾病中的病理机制和功能, 并进行创新药物研发。

在这项探索性蛋白质组学研究中，来自瑞典哥德堡大学神经科学研究所的研究者们分析了情绪稳定型双相情感障碍患者和两个独立队列中的对照受试者的脑脊液中的201种蛋白质，共204名患者和144名对照。总之，这项对双相情感障碍患者进行的探索性脑脊液研究表明，与对照组相比，双相情感障碍患者的脑脊液生长激素浓度较低。

特别是单细胞染色质可及性测序数据，能够以前所未有的分辨率表征表观组的异质性和调控模式。为此，厦门大学王颖、南开大学陈盛泉课题组联合开发了一个对不同单细胞染色质开放性测序数据，进行异质双联体细胞有效识别并去除的新工具。与其他方法相比，scIBD在识别doublet的准确性和后续的生物分析上具有卓越表现。

文章描述了一种非接触超声辅助的高通量微量的磷酸化蛋白质组学策略。该策略基于一种可控温的非接触超声仪来快速酶解蛋白，且针对微量样本优化了后续磷酸化富集流程，整个工作流程只需3小时就可完成24个磷酸化蛋白质组学样品的制备。

通过使用嵌入信息，DeepCCI将细胞分成若干组。此外，DeepCCI还提供了几个可视化输出，以显示每个细胞簇与其他细胞簇相互作用的强度或特异性。结果表明，DeepCCI在从scRNA-seq数据中捕捉细胞之间的生物学关系和CCI预测方面具有良好的潜力。e, DeepCCI联合使用ResNet和GCN预测细胞簇之间的相互作用。

基于基因增强子与启动子远程通讯的特点，他们猜测IKAROS可能通过调控基因组的3D构象来实现对淋巴细胞相关基因的时空调控并限制非相关基因的表达。研究者继而以Igk抗体轻链基因簇为例，全面揭示了IKAROS对基因组的拓扑结构调控。

表观遗传学作为近10年来炙手可热的方向，其研究已经深入到各个学科和领域，促进了医学，动物学，植物学，生殖发育等学科的发展。表观遗传学在许多领域都有重要的应用；对于理解生物学、疾病和进化等方面具有广泛的意义。为助力科研工作者了解多组学技术，掌握前沿研究的应用和转化方向，由上海市生物医药行业协会、广州新式会展服务有限公司共同主办的第二届多组学科研与临床应用大会将于2024年3月30-31日在上海举行，同期将举办染色质与表观遗传在精准医学中的应用及微生物组学与人类健康论坛，大会旨在促进科研成果转化，加强各研究领域的信息与资源的共享，并通过会议把多组学从基础科研快速推进到临床。

目前，单细胞多组学技术日益成熟，测序数据也在不断增长。然而，不同组学组合、不同测序技术、不同测序样本的“马赛克”式单细胞数据的整合是该领域的巨大挑战。为此，应晓敏团队和伯晓晨团队自主研发了基于生成式人工智能的新算法MIDAS。此外，基于MIDAS降维后的隐变量可以对模态缺失的马赛克数据进行拟时序分析。

近年来，以蛋白质组为核心的临床大队列样本多组学研究策略通过构建肿瘤分子图谱全景，全面系统揭示了多类肿瘤的分子特征及潜在治疗策略。最后，研究人员利用多组学数据基于非负矩阵分解算法将小细胞肺癌分为四个亚型，系统表征了各亚型独特的分子特征并提出潜在治疗策略。

近日，南方医科大学基础医学院李琳团队与广州医科大学附属第三医院李磊团队合作，解析了人类着床前胚胎发育阻滞的调控机制。该研究首次揭示人类和小鼠的着床前胚胎中合子基因组激活均不依赖于有丝分裂，而是依赖于发育时间。

而免疫细胞比例、状态等均与细胞功能密切相关。近日，四川大学华西医院实验医学科应斌武教授团队近期在Advanced Science发表题为Single-Cell Sequencing Reveals Functional Alterations in Tuberculosis的研究文章，研究利用单细胞转录组测序技术和单细胞表面抗体测序技术，揭示了结核病患者外周血中各类T细胞功能的特异性改变，进一步强调了免疫治疗对于抗结核治疗的价值。

然而，不同的乳腺癌患者对新辅助化疗的敏感性不同。因此，解析与乳腺癌新辅助化疗相关的分子特征、精准筛选对新辅助化疗响应的乳腺癌患者是乳腺癌治疗领域亟待解决的重要临床及科学问题。

随着人类基因组计划的完成，因对基因组的解读需求，后基因组时代到来；蛋白质是生命活动的功能执行者，是基因编码的终产物和药物作用于体内的直接靶标，我们期待借助超高分辨质谱技术为依赖的蛋白质组学技术来解读基因组学的天书，让质谱表征的蛋白质组学能够为生命活动提供更加贴近表型的解释。

衰老是心血管疾病的首要危险因素，可导致心脏结构异常和功能衰退，如室壁肥厚、舒张功能障碍、纤维性颤动等。该研究首次基于食蟹猴衰老心脏转录组和蛋白组的联合分析，揭示了SIRT2通过去乙酰化STAT3进而延缓灵长类心肌衰老的新机制，并通过SIRT2基因疗法实现了衰老心脏功能的逆转。

利用prox-SLIAC技术，该研究实现对线粒体基质和内质网腔内蛋白质动态变化的精确鉴定，并揭示了内质网应激状态以及细胞分化过程中内质网腔内蛋白质代谢水平的差异变化。同样地，该变化趋势仍无法通过pulse-SILAC体现，凸显了亚细胞层面表征蛋白质动态变化的意义。

近年来，在转录组中发现的各种RNA编辑修饰促进了表观转录组学领域的迅速发展。这些RNA编辑修饰位点在调控RNA代谢的各个层面发挥着关键作用，并广泛涉及到多种生物过程，具备重要的功能。例如，m5C修饰在胚胎发育、肿瘤发展和病毒调控中扮演着重要角色，而m6A修饰和A-to-I编辑酶在多种癌症中异常调节，被认为是有潜力的癌症治疗靶点。

近年来大量科学先后报道了空间多组学技术在不同领域的重大突破和发现。为了进一步促进空间多组学在临床医学研究中的应用，促进科研成果转化，加强各研究领域的信息与资源的共享，第二届多组学科研与临床应用大会将于2024年3月30-31日在上海举行，同期将举办空间多组学技术与临床应用论坛。

他们利用多组学数据注释了930个癌细胞系，构建了第二代Cancer DepMap，并分析了来自CRISPR-Cas9筛选的分子标记与癌症依赖性之间的关系。